Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FZD3Q9NPG1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FZD3Q9NPG1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FZD3Q9NPG1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FZD3Q9NPG1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FZD3Q9NPG1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FZD3Q9NPG1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FZD3Q9NPG1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FZD3Q9NPG1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FZD3Q9NPG1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FZD3Q9NPG1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FZD3Q9NPG1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FZD3Q9NPG1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FZD3Q9NPG1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FZD3Q9NPG1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FZD3Q9NPG1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FZD3Q9NPG1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FZD3Q9NPG1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FZD3Q9NPG1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FZD3Q9NPG1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FZD3Q9NPG1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FZD3Q9NPG1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FZD3Q9NPG1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FZD3Q9NPG1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FZD3Q9NPG1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FZD3Q9NPG1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FZD3Q9NPG1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FZD3Q9NPG1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FZD3Q9NPG1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FZD3Q9NPG1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FZD3Q9NPG1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FZD3Q9NPG1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FZD3Q9NPG1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FZD3Q9NPG1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FZD3Q9NPG1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FZD3Q9NPG1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FZD3Q9NPG1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FZD3Q9NPG1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FZD3Q9NPG1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FZD3Q9NPG1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FZD3Q9NPG1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FZD3Q9NPG1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FZD3Q9NPG1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FZD3Q9NPG1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FZD3Q9NPG1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FZD3Q9NPG1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FZD3Q9NPG1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FZD3Q9NPG1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FZD3Q9NPG1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FZD3Q9NPG1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FZD3Q9NPG1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FZD3Q9NPG1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FZD3Q9NPG1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FZD3Q9NPG1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FZD3Q9NPG1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FZD3Q9NPG1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FZD3Q9NPG1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FZD3Q9NPG1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FZD3Q9NPG1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FZD3Q9NPG1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FZD3Q9NPG1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FZD3Q9NPG1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FZD3Q9NPG1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FZD3Q9NPG1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FZD3Q9NPG1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FZD3Q9NPG1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FZD3Q9NPG1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FZD3Q9NPG1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FZD3Q9NPG1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms