Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HMG20AQ9NP66 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HMG20AQ9NP66 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HMG20AQ9NP66 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HMG20AQ9NP66 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HMG20AQ9NP66 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HMG20AQ9NP66 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMG20AQ9NP66 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMG20AQ9NP66 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMG20AQ9NP66 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMG20AQ9NP66 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMG20AQ9NP66 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMG20AQ9NP66 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMG20AQ9NP66 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HMG20AQ9NP66 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMG20AQ9NP66 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMG20AQ9NP66 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMG20AQ9NP66 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMG20AQ9NP66 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMG20AQ9NP66 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMG20AQ9NP66 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMG20AQ9NP66 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMG20AQ9NP66 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMG20AQ9NP66 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMG20AQ9NP66 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMG20AQ9NP66 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMG20AQ9NP66 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMG20AQ9NP66 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMG20AQ9NP66 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMG20AQ9NP66 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMG20AQ9NP66 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMG20AQ9NP66 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HMG20AQ9NP66 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMG20AQ9NP66 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMG20AQ9NP66 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMG20AQ9NP66 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMG20AQ9NP66 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMG20AQ9NP66 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMG20AQ9NP66 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMG20AQ9NP66 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMG20AQ9NP66 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMG20AQ9NP66 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMG20AQ9NP66 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HMG20AQ9NP66 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HMG20AQ9NP66 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HMG20AQ9NP66 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HMG20AQ9NP66 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HMG20AQ9NP66 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HMG20AQ9NP66 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HMG20AQ9NP66 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HMG20AQ9NP66 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HMG20AQ9NP66 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HMG20AQ9NP66 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HMG20AQ9NP66 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HMG20AQ9NP66 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HMG20AQ9NP66 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HMG20AQ9NP66 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HMG20AQ9NP66 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HMG20AQ9NP66 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HMG20AQ9NP66 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HMG20AQ9NP66 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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