Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE7BQ9NP56 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE7BQ9NP56 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE7BQ9NP56 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE7BQ9NP56 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE7BQ9NP56 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE7BQ9NP56 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE7BQ9NP56 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PDE7BQ9NP56 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE7BQ9NP56 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE7BQ9NP56 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE7BQ9NP56 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE7BQ9NP56 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE7BQ9NP56 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE7BQ9NP56 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE7BQ9NP56 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE7BQ9NP56 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE7BQ9NP56 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE7BQ9NP56 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE7BQ9NP56 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE7BQ9NP56 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE7BQ9NP56 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE7BQ9NP56 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE7BQ9NP56 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE7BQ9NP56 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PDE7BQ9NP56 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE7BQ9NP56 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE7BQ9NP56 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE7BQ9NP56 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE7BQ9NP56 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE7BQ9NP56 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE7BQ9NP56 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE7BQ9NP56 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE7BQ9NP56 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE7BQ9NP56 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE7BQ9NP56 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PDE7BQ9NP56 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE7BQ9NP56 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE7BQ9NP56 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE7BQ9NP56 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE7BQ9NP56 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PDE7BQ9NP56 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE7BQ9NP56 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE7BQ9NP56 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE7BQ9NP56 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE7BQ9NP56 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE7BQ9NP56 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE7BQ9NP56 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE7BQ9NP56 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE7BQ9NP56 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE7BQ9NP56 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE7BQ9NP56 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE7BQ9NP56 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE7BQ9NP56 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE7BQ9NP56 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE7BQ9NP56 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE7BQ9NP56 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE7BQ9NP56 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE7BQ9NP56 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE7BQ9NP56 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE7BQ9NP56 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE7BQ9NP56 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE7BQ9NP56 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE7BQ9NP56 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE7BQ9NP56 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE7BQ9NP56 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE7BQ9NP56 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE7BQ9NP56 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE7BQ9NP56 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE7BQ9NP56 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE7BQ9NP56 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE7BQ9NP56 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE7BQ9NP56 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE7BQ9NP56 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE7BQ9NP56 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE7BQ9NP56 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE7BQ9NP56 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE7BQ9NP56 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE7BQ9NP56 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE7BQ9NP56 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE7BQ9NP56 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE7BQ9NP56 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE7BQ9NP56 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE7BQ9NP56 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE7BQ9NP56 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE7BQ9NP56 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE7BQ9NP56 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE7BQ9NP56 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE7BQ9NP56 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE7BQ9NP56 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE7BQ9NP56 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE7BQ9NP56 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE7BQ9NP56 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE7BQ9NP56 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE7BQ9NP56 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE7BQ9NP56 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE7BQ9NP56 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE7BQ9NP56 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE7BQ9NP56 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE7BQ9NP56 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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