Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP08

HMX1, Homeobox protein HMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX1Q9NP08 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMX1Q9NP08 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMX1Q9NP08 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMX1Q9NP08 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMX1Q9NP08 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMX1Q9NP08 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMX1Q9NP08 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMX1Q9NP08 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMX1Q9NP08 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMX1Q9NP08 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMX1Q9NP08 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMX1Q9NP08 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMX1Q9NP08 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMX1Q9NP08 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMX1Q9NP08 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMX1Q9NP08 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMX1Q9NP08 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMX1Q9NP08 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMX1Q9NP08 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMX1Q9NP08 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMX1Q9NP08 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HMX1Q9NP08 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMX1Q9NP08 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMX1Q9NP08 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HMX1Q9NP08 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HMX1Q9NP08 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HMX1Q9NP08 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HMX1Q9NP08 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HMX1Q9NP08 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HMX1Q9NP08 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HMX1Q9NP08 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HMX1Q9NP08 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HMX1Q9NP08 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HMX1Q9NP08 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HMX1Q9NP08 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HMX1Q9NP08 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HMX1Q9NP08 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HMX1Q9NP08 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HMX1Q9NP08 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
HMX1Q9NP08 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
HMX1Q9NP08 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HMX1Q9NP08 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HMX1Q9NP08 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HMX1Q9NP08 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HMX1Q9NP08 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HMX1Q9NP08 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HMX1Q9NP08 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HMX1Q9NP08 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HMX1Q9NP08 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HMX1Q9NP08 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HMX1Q9NP08 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HMX1Q9NP08 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMX1Q9NP08 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMX1Q9NP08 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMX1Q9NP08 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMX1Q9NP08 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HMX1Q9NP08 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMX1Q9NP08 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HMX1Q9NP08 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMX1Q9NP08 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMX1Q9NP08 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMX1Q9NP08 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HMX1Q9NP08 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HMX1Q9NP08 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HMX1Q9NP08 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HMX1Q9NP08 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HMX1Q9NP08 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HMX1Q9NP08 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HMX1Q9NP08 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HMX1Q9NP08 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HMX1Q9NP08 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HMX1Q9NP08 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HMX1Q9NP08 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HMX1Q9NP08 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HMX1Q9NP08 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HMX1Q9NP08 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HMX1Q9NP08 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HMX1Q9NP08 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HMX1Q9NP08 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HMX1Q9NP08 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HMX1Q9NP08 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HMX1Q9NP08 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HMX1Q9NP08 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HMX1Q9NP08 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HMX1Q9NP08 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HMX1Q9NP08 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HMX1Q9NP08 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HMX1Q9NP08 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HMX1Q9NP08 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HMX1Q9NP08 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HMX1Q9NP08 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HMX1Q9NP08 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HMX1Q9NP08 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HMX1Q9NP08 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HMX1Q9NP08 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HMX1Q9NP08 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMX1Q9NP08 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMX1Q9NP08 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMX1Q9NP08 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMX1Q9NP08 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms