Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KIAA1549Q9HCM3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KIAA1549Q9HCM3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms