Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC58

SLC24A3, Sodium/potassium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A3Q9HC58 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC24A3Q9HC58 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms