Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOBEC3GQ9HC16 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms