Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB58

SP110, Sp110 nuclear body protein, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP110Q9HB58 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SP110Q9HB58 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SP110Q9HB58 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SP110Q9HB58 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SP110Q9HB58 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SP110Q9HB58 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SP110Q9HB58 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SP110Q9HB58 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SP110Q9HB58 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SP110Q9HB58 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SP110Q9HB58 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SP110Q9HB58 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SP110Q9HB58 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SP110Q9HB58 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SP110Q9HB58 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SP110Q9HB58 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SP110Q9HB58 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SP110Q9HB58 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SP110Q9HB58 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SP110Q9HB58 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SP110Q9HB58 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SP110Q9HB58 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SP110Q9HB58 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SP110Q9HB58 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SP110Q9HB58 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SP110Q9HB58 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SP110Q9HB58 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SP110Q9HB58 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SP110Q9HB58 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SP110Q9HB58 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SP110Q9HB58 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SP110Q9HB58 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SP110Q9HB58 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SP110Q9HB58 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SP110Q9HB58 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SP110Q9HB58 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SP110Q9HB58 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SP110Q9HB58 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SP110Q9HB58 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SP110Q9HB58 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SP110Q9HB58 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SP110Q9HB58 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SP110Q9HB58 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SP110Q9HB58 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SP110Q9HB58 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SP110Q9HB58 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SP110Q9HB58 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SP110Q9HB58 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SP110Q9HB58 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SP110Q9HB58 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SP110Q9HB58 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SP110Q9HB58 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SP110Q9HB58 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SP110Q9HB58 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SP110Q9HB58 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SP110Q9HB58 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SP110Q9HB58 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SP110Q9HB58 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SP110Q9HB58 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SP110Q9HB58 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SP110Q9HB58 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SP110Q9HB58 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SP110Q9HB58 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SP110Q9HB58 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SP110Q9HB58 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SP110Q9HB58 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SP110Q9HB58 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SP110Q9HB58 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SP110Q9HB58 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SP110Q9HB58 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SP110Q9HB58 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SP110Q9HB58 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SP110Q9HB58 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SP110Q9HB58 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SP110Q9HB58 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SP110Q9HB58 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SP110Q9HB58 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SP110Q9HB58 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SP110Q9HB58 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SP110Q9HB58 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SP110Q9HB58 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SP110Q9HB58 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SP110Q9HB58 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SP110Q9HB58 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SP110Q9HB58 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SP110Q9HB58 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SP110Q9HB58 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SP110Q9HB58 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SP110Q9HB58 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SP110Q9HB58 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SP110Q9HB58 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SP110Q9HB58 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SP110Q9HB58 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SP110Q9HB58 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SP110Q9HB58 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SP110Q9HB58 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SP110Q9HB58 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SP110Q9HB58 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SP110Q9HB58 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SP110Q9HB58 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms