Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9E3

COG4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG4Q9H9E3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COG4Q9H9E3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COG4Q9H9E3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COG4Q9H9E3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COG4Q9H9E3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COG4Q9H9E3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COG4Q9H9E3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COG4Q9H9E3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COG4Q9H9E3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COG4Q9H9E3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COG4Q9H9E3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COG4Q9H9E3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COG4Q9H9E3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COG4Q9H9E3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COG4Q9H9E3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COG4Q9H9E3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COG4Q9H9E3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COG4Q9H9E3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COG4Q9H9E3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COG4Q9H9E3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COG4Q9H9E3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COG4Q9H9E3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COG4Q9H9E3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COG4Q9H9E3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COG4Q9H9E3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COG4Q9H9E3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COG4Q9H9E3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COG4Q9H9E3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COG4Q9H9E3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COG4Q9H9E3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG4Q9H9E3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG4Q9H9E3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG4Q9H9E3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG4Q9H9E3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG4Q9H9E3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG4Q9H9E3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG4Q9H9E3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG4Q9H9E3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG4Q9H9E3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG4Q9H9E3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG4Q9H9E3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG4Q9H9E3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG4Q9H9E3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG4Q9H9E3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG4Q9H9E3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG4Q9H9E3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG4Q9H9E3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG4Q9H9E3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG4Q9H9E3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG4Q9H9E3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG4Q9H9E3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG4Q9H9E3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG4Q9H9E3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG4Q9H9E3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG4Q9H9E3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG4Q9H9E3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG4Q9H9E3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG4Q9H9E3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG4Q9H9E3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG4Q9H9E3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG4Q9H9E3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG4Q9H9E3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG4Q9H9E3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG4Q9H9E3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG4Q9H9E3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms