Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NRDE2Q9H7Z3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NRDE2Q9H7Z3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NRDE2Q9H7Z3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NRDE2Q9H7Z3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NRDE2Q9H7Z3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NRDE2Q9H7Z3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NRDE2Q9H7Z3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NRDE2Q9H7Z3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NRDE2Q9H7Z3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NRDE2Q9H7Z3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NRDE2Q9H7Z3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NRDE2Q9H7Z3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NRDE2Q9H7Z3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NRDE2Q9H7Z3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NRDE2Q9H7Z3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NRDE2Q9H7Z3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NRDE2Q9H7Z3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NRDE2Q9H7Z3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NRDE2Q9H7Z3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NRDE2Q9H7Z3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NRDE2Q9H7Z3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NRDE2Q9H7Z3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NRDE2Q9H7Z3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NRDE2Q9H7Z3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NRDE2Q9H7Z3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NRDE2Q9H7Z3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NRDE2Q9H7Z3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NRDE2Q9H7Z3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NRDE2Q9H7Z3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NRDE2Q9H7Z3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NRDE2Q9H7Z3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NRDE2Q9H7Z3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NRDE2Q9H7Z3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NRDE2Q9H7Z3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NRDE2Q9H7Z3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NRDE2Q9H7Z3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NRDE2Q9H7Z3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NRDE2Q9H7Z3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NRDE2Q9H7Z3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NRDE2Q9H7Z3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NRDE2Q9H7Z3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NRDE2Q9H7Z3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NRDE2Q9H7Z3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NRDE2Q9H7Z3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms