Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B2

RPF2, Ribosome production factor 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPF2Q9H7B2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPF2Q9H7B2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPF2Q9H7B2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms