Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NXF3Q9H4D5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NXF3Q9H4D5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NXF3Q9H4D5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NXF3Q9H4D5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NXF3Q9H4D5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NXF3Q9H4D5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NXF3Q9H4D5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NXF3Q9H4D5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NXF3Q9H4D5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NXF3Q9H4D5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NXF3Q9H4D5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NXF3Q9H4D5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NXF3Q9H4D5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NXF3Q9H4D5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NXF3Q9H4D5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NXF3Q9H4D5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NXF3Q9H4D5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NXF3Q9H4D5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NXF3Q9H4D5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NXF3Q9H4D5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NXF3Q9H4D5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NXF3Q9H4D5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NXF3Q9H4D5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NXF3Q9H4D5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NXF3Q9H4D5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NXF3Q9H4D5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NXF3Q9H4D5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NXF3Q9H4D5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NXF3Q9H4D5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NXF3Q9H4D5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NXF3Q9H4D5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NXF3Q9H4D5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NXF3Q9H4D5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NXF3Q9H4D5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NXF3Q9H4D5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NXF3Q9H4D5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NXF3Q9H4D5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NXF3Q9H4D5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NXF3Q9H4D5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NXF3Q9H4D5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NXF3Q9H4D5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NXF3Q9H4D5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NXF3Q9H4D5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NXF3Q9H4D5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NXF3Q9H4D5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NXF3Q9H4D5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NXF3Q9H4D5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NXF3Q9H4D5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NXF3Q9H4D5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NXF3Q9H4D5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NXF3Q9H4D5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NXF3Q9H4D5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NXF3Q9H4D5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NXF3Q9H4D5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NXF3Q9H4D5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NXF3Q9H4D5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NXF3Q9H4D5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NXF3Q9H4D5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NXF3Q9H4D5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NXF3Q9H4D5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NXF3Q9H4D5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NXF3Q9H4D5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NXF3Q9H4D5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NXF3Q9H4D5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NXF3Q9H4D5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NXF3Q9H4D5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NXF3Q9H4D5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NXF3Q9H4D5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NXF3Q9H4D5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NXF3Q9H4D5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NXF3Q9H4D5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NXF3Q9H4D5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NXF3Q9H4D5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NXF3Q9H4D5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NXF3Q9H4D5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NXF3Q9H4D5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NXF3Q9H4D5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NXF3Q9H4D5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NXF3Q9H4D5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NXF3Q9H4D5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NXF3Q9H4D5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NXF3Q9H4D5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NXF3Q9H4D5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NXF3Q9H4D5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NXF3Q9H4D5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NXF3Q9H4D5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NXF3Q9H4D5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NXF3Q9H4D5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NXF3Q9H4D5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NXF3Q9H4D5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NXF3Q9H4D5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NXF3Q9H4D5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NXF3Q9H4D5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NXF3Q9H4D5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NXF3Q9H4D5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NXF3Q9H4D5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NXF3Q9H4D5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NXF3Q9H4D5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NXF3Q9H4D5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
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