Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3T2

SEMA6C, Semaphorin-6C, humanhuman

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6CQ9H3T2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA6CQ9H3T2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA6CQ9H3T2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA6CQ9H3T2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA6CQ9H3T2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA6CQ9H3T2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA6CQ9H3T2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA6CQ9H3T2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA6CQ9H3T2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA6CQ9H3T2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA6CQ9H3T2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA6CQ9H3T2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA6CQ9H3T2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA6CQ9H3T2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA6CQ9H3T2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA6CQ9H3T2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA6CQ9H3T2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA6CQ9H3T2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA6CQ9H3T2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA6CQ9H3T2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA6CQ9H3T2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA6CQ9H3T2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA6CQ9H3T2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA6CQ9H3T2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA6CQ9H3T2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA6CQ9H3T2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA6CQ9H3T2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA6CQ9H3T2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA6CQ9H3T2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA6CQ9H3T2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA6CQ9H3T2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA6CQ9H3T2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA6CQ9H3T2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA6CQ9H3T2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA6CQ9H3T2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA6CQ9H3T2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA6CQ9H3T2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA6CQ9H3T2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA6CQ9H3T2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA6CQ9H3T2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA6CQ9H3T2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA6CQ9H3T2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA6CQ9H3T2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA6CQ9H3T2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA6CQ9H3T2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA6CQ9H3T2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA6CQ9H3T2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA6CQ9H3T2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA6CQ9H3T2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA6CQ9H3T2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA6CQ9H3T2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA6CQ9H3T2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA6CQ9H3T2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA6CQ9H3T2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA6CQ9H3T2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA6CQ9H3T2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA6CQ9H3T2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA6CQ9H3T2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA6CQ9H3T2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA6CQ9H3T2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA6CQ9H3T2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA6CQ9H3T2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA6CQ9H3T2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA6CQ9H3T2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA6CQ9H3T2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA6CQ9H3T2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA6CQ9H3T2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA6CQ9H3T2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA6CQ9H3T2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA6CQ9H3T2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA6CQ9H3T2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA6CQ9H3T2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA6CQ9H3T2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA6CQ9H3T2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA6CQ9H3T2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA6CQ9H3T2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA6CQ9H3T2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA6CQ9H3T2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA6CQ9H3T2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA6CQ9H3T2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA6CQ9H3T2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA6CQ9H3T2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA6CQ9H3T2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA6CQ9H3T2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA6CQ9H3T2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA6CQ9H3T2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA6CQ9H3T2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA6CQ9H3T2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA6CQ9H3T2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA6CQ9H3T2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA6CQ9H3T2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA6CQ9H3T2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA6CQ9H3T2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA6CQ9H3T2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA6CQ9H3T2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA6CQ9H3T2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA6CQ9H3T2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA6CQ9H3T2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA6CQ9H3T2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA6CQ9H3T2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110 ms