Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NBPF3Q9H094 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NBPF3Q9H094 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NBPF3Q9H094 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NBPF3Q9H094 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NBPF3Q9H094 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NBPF3Q9H094 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NBPF3Q9H094 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NBPF3Q9H094 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NBPF3Q9H094 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NBPF3Q9H094 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NBPF3Q9H094 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NBPF3Q9H094 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NBPF3Q9H094 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NBPF3Q9H094 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NBPF3Q9H094 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NBPF3Q9H094 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NBPF3Q9H094 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NBPF3Q9H094 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NBPF3Q9H094 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NBPF3Q9H094 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NBPF3Q9H094 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NBPF3Q9H094 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NBPF3Q9H094 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NBPF3Q9H094 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NBPF3Q9H094 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NBPF3Q9H094 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NBPF3Q9H094 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NBPF3Q9H094 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
NBPF3Q9H094 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NBPF3Q9H094 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NBPF3Q9H094 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NBPF3Q9H094 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NBPF3Q9H094 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NBPF3Q9H094 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NBPF3Q9H094 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NBPF3Q9H094 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NBPF3Q9H094 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NBPF3Q9H094 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NBPF3Q9H094 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NBPF3Q9H094 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NBPF3Q9H094 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NBPF3Q9H094 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NBPF3Q9H094 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NBPF3Q9H094 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NBPF3Q9H094 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NBPF3Q9H094 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NBPF3Q9H094 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NBPF3Q9H094 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NBPF3Q9H094 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NBPF3Q9H094 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NBPF3Q9H094 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NBPF3Q9H094 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NBPF3Q9H094 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NBPF3Q9H094 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NBPF3Q9H094 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NBPF3Q9H094 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NBPF3Q9H094 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NBPF3Q9H094 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NBPF3Q9H094 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NBPF3Q9H094 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NBPF3Q9H094 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NBPF3Q9H094 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NBPF3Q9H094 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NBPF3Q9H094 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NBPF3Q9H094 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NBPF3Q9H094 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NBPF3Q9H094 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NBPF3Q9H094 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NBPF3Q9H094 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NBPF3Q9H094 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NBPF3Q9H094 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NBPF3Q9H094 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NBPF3Q9H094 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NBPF3Q9H094 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NBPF3Q9H094 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NBPF3Q9H094 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NBPF3Q9H094 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NBPF3Q9H094 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NBPF3Q9H094 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NBPF3Q9H094 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NBPF3Q9H094 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NBPF3Q9H094 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NBPF3Q9H094 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NBPF3Q9H094 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NBPF3Q9H094 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NBPF3Q9H094 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NBPF3Q9H094 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NBPF3Q9H094 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NBPF3Q9H094 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NBPF3Q9H094 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NBPF3Q9H094 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NBPF3Q9H094 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NBPF3Q9H094 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NBPF3Q9H094 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NBPF3Q9H094 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NBPF3Q9H094 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NBPF3Q9H094 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NBPF3Q9H094 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NBPF3Q9H094 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms