Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR2

REXO4, RNA exonuclease 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO4Q9GZR2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
REXO4Q9GZR2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
REXO4Q9GZR2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
REXO4Q9GZR2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
REXO4Q9GZR2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
REXO4Q9GZR2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
REXO4Q9GZR2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
REXO4Q9GZR2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
REXO4Q9GZR2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
REXO4Q9GZR2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
REXO4Q9GZR2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
REXO4Q9GZR2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
REXO4Q9GZR2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
REXO4Q9GZR2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
REXO4Q9GZR2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
REXO4Q9GZR2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
REXO4Q9GZR2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
REXO4Q9GZR2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
REXO4Q9GZR2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
REXO4Q9GZR2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
REXO4Q9GZR2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
REXO4Q9GZR2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
REXO4Q9GZR2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
REXO4Q9GZR2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
REXO4Q9GZR2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
REXO4Q9GZR2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
REXO4Q9GZR2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
REXO4Q9GZR2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
REXO4Q9GZR2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
REXO4Q9GZR2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
REXO4Q9GZR2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
REXO4Q9GZR2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
REXO4Q9GZR2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
REXO4Q9GZR2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
REXO4Q9GZR2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
REXO4Q9GZR2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
REXO4Q9GZR2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
REXO4Q9GZR2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
REXO4Q9GZR2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
REXO4Q9GZR2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
REXO4Q9GZR2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
REXO4Q9GZR2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
REXO4Q9GZR2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
REXO4Q9GZR2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
REXO4Q9GZR2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
REXO4Q9GZR2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
REXO4Q9GZR2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
REXO4Q9GZR2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
REXO4Q9GZR2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
REXO4Q9GZR2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
REXO4Q9GZR2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
REXO4Q9GZR2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
REXO4Q9GZR2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
REXO4Q9GZR2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
REXO4Q9GZR2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
REXO4Q9GZR2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
REXO4Q9GZR2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
REXO4Q9GZR2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
REXO4Q9GZR2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
REXO4Q9GZR2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
REXO4Q9GZR2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
REXO4Q9GZR2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
REXO4Q9GZR2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
REXO4Q9GZR2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
REXO4Q9GZR2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
REXO4Q9GZR2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
REXO4Q9GZR2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
REXO4Q9GZR2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms