Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZL7

WDR12, Ribosome biogenesis protein WDR12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR12Q9GZL7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
WDR12Q9GZL7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
WDR12Q9GZL7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
WDR12Q9GZL7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
WDR12Q9GZL7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
WDR12Q9GZL7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
WDR12Q9GZL7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
WDR12Q9GZL7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
WDR12Q9GZL7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
WDR12Q9GZL7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
WDR12Q9GZL7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
WDR12Q9GZL7 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
WDR12Q9GZL7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
WDR12Q9GZL7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
WDR12Q9GZL7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
WDR12Q9GZL7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
WDR12Q9GZL7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
WDR12Q9GZL7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
WDR12Q9GZL7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
WDR12Q9GZL7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
WDR12Q9GZL7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
WDR12Q9GZL7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
WDR12Q9GZL7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
WDR12Q9GZL7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
WDR12Q9GZL7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
WDR12Q9GZL7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
WDR12Q9GZL7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
WDR12Q9GZL7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
WDR12Q9GZL7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
WDR12Q9GZL7 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
WDR12Q9GZL7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
WDR12Q9GZL7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
WDR12Q9GZL7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
WDR12Q9GZL7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
WDR12Q9GZL7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
WDR12Q9GZL7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
WDR12Q9GZL7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
WDR12Q9GZL7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
WDR12Q9GZL7 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
WDR12Q9GZL7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
WDR12Q9GZL7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
WDR12Q9GZL7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
WDR12Q9GZL7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
WDR12Q9GZL7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
WDR12Q9GZL7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
WDR12Q9GZL7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
WDR12Q9GZL7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
WDR12Q9GZL7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
WDR12Q9GZL7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
WDR12Q9GZL7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
WDR12Q9GZL7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
WDR12Q9GZL7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
WDR12Q9GZL7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
WDR12Q9GZL7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
WDR12Q9GZL7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
WDR12Q9GZL7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
WDR12Q9GZL7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
WDR12Q9GZL7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
WDR12Q9GZL7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
WDR12Q9GZL7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
WDR12Q9GZL7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
WDR12Q9GZL7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
WDR12Q9GZL7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
WDR12Q9GZL7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
WDR12Q9GZL7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
WDR12Q9GZL7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
WDR12Q9GZL7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
WDR12Q9GZL7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
WDR12Q9GZL7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
WDR12Q9GZL7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
WDR12Q9GZL7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
WDR12Q9GZL7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
WDR12Q9GZL7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
WDR12Q9GZL7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
WDR12Q9GZL7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
WDR12Q9GZL7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
WDR12Q9GZL7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
WDR12Q9GZL7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
WDR12Q9GZL7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
WDR12Q9GZL7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
WDR12Q9GZL7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
WDR12Q9GZL7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
WDR12Q9GZL7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
WDR12Q9GZL7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
WDR12Q9GZL7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
WDR12Q9GZL7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
WDR12Q9GZL7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
WDR12Q9GZL7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
WDR12Q9GZL7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
WDR12Q9GZL7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
WDR12Q9GZL7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
WDR12Q9GZL7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
WDR12Q9GZL7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
WDR12Q9GZL7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
WDR12Q9GZL7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
WDR12Q9GZL7 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
WDR12Q9GZL7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
WDR12Q9GZL7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
WDR12Q9GZL7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
WDR12Q9GZL7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms