Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B6

BRINP2, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP2Q9C0B6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRINP2Q9C0B6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRINP2Q9C0B6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRINP2Q9C0B6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRINP2Q9C0B6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRINP2Q9C0B6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRINP2Q9C0B6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRINP2Q9C0B6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRINP2Q9C0B6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRINP2Q9C0B6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRINP2Q9C0B6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRINP2Q9C0B6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRINP2Q9C0B6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRINP2Q9C0B6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRINP2Q9C0B6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRINP2Q9C0B6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRINP2Q9C0B6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRINP2Q9C0B6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRINP2Q9C0B6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRINP2Q9C0B6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRINP2Q9C0B6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRINP2Q9C0B6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRINP2Q9C0B6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRINP2Q9C0B6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRINP2Q9C0B6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRINP2Q9C0B6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRINP2Q9C0B6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRINP2Q9C0B6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRINP2Q9C0B6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRINP2Q9C0B6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRINP2Q9C0B6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRINP2Q9C0B6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRINP2Q9C0B6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRINP2Q9C0B6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BRINP2Q9C0B6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRINP2Q9C0B6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRINP2Q9C0B6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRINP2Q9C0B6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRINP2Q9C0B6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRINP2Q9C0B6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRINP2Q9C0B6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRINP2Q9C0B6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRINP2Q9C0B6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRINP2Q9C0B6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRINP2Q9C0B6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRINP2Q9C0B6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRINP2Q9C0B6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRINP2Q9C0B6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRINP2Q9C0B6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRINP2Q9C0B6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRINP2Q9C0B6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRINP2Q9C0B6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRINP2Q9C0B6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRINP2Q9C0B6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BRINP2Q9C0B6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BRINP2Q9C0B6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRINP2Q9C0B6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRINP2Q9C0B6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRINP2Q9C0B6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BRINP2Q9C0B6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BRINP2Q9C0B6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BRINP2Q9C0B6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BRINP2Q9C0B6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRINP2Q9C0B6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRINP2Q9C0B6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRINP2Q9C0B6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRINP2Q9C0B6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRINP2Q9C0B6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRINP2Q9C0B6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRINP2Q9C0B6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRINP2Q9C0B6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRINP2Q9C0B6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRINP2Q9C0B6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRINP2Q9C0B6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRINP2Q9C0B6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRINP2Q9C0B6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRINP2Q9C0B6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRINP2Q9C0B6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRINP2Q9C0B6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRINP2Q9C0B6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRINP2Q9C0B6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRINP2Q9C0B6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRINP2Q9C0B6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRINP2Q9C0B6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRINP2Q9C0B6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRINP2Q9C0B6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRINP2Q9C0B6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRINP2Q9C0B6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRINP2Q9C0B6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRINP2Q9C0B6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRINP2Q9C0B6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BRINP2Q9C0B6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BRINP2Q9C0B6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRINP2Q9C0B6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRINP2Q9C0B6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRINP2Q9C0B6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRINP2Q9C0B6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRINP2Q9C0B6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRINP2Q9C0B6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRINP2Q9C0B6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms