Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
BCO2Q9BYV7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
BCO2Q9BYV7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BCO2Q9BYV7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BCO2Q9BYV7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
BCO2Q9BYV7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BCO2Q9BYV7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
BCO2Q9BYV7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BCO2Q9BYV7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BCO2Q9BYV7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BCO2Q9BYV7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BCO2Q9BYV7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
BCO2Q9BYV7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BCO2Q9BYV7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BCO2Q9BYV7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BCO2Q9BYV7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BCO2Q9BYV7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BCO2Q9BYV7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BCO2Q9BYV7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BCO2Q9BYV7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BCO2Q9BYV7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BCO2Q9BYV7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
BCO2Q9BYV7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
BCO2Q9BYV7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BCO2Q9BYV7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BCO2Q9BYV7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
BCO2Q9BYV7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
BCO2Q9BYV7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
BCO2Q9BYV7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
BCO2Q9BYV7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
BCO2Q9BYV7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BCO2Q9BYV7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BCO2Q9BYV7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BCO2Q9BYV7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
BCO2Q9BYV7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BCO2Q9BYV7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BCO2Q9BYV7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BCO2Q9BYV7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BCO2Q9BYV7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BCO2Q9BYV7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BCO2Q9BYV7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BCO2Q9BYV7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BCO2Q9BYV7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BCO2Q9BYV7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BCO2Q9BYV7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BCO2Q9BYV7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BCO2Q9BYV7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BCO2Q9BYV7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BCO2Q9BYV7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BCO2Q9BYV7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BCO2Q9BYV7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms