Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM54Q9BYV2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM54Q9BYV2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM54Q9BYV2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM54Q9BYV2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM54Q9BYV2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM54Q9BYV2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM54Q9BYV2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM54Q9BYV2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM54Q9BYV2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM54Q9BYV2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM54Q9BYV2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM54Q9BYV2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM54Q9BYV2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM54Q9BYV2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM54Q9BYV2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM54Q9BYV2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM54Q9BYV2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM54Q9BYV2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM54Q9BYV2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM54Q9BYV2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM54Q9BYV2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM54Q9BYV2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM54Q9BYV2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM54Q9BYV2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM54Q9BYV2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM54Q9BYV2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM54Q9BYV2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM54Q9BYV2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM54Q9BYV2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM54Q9BYV2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM54Q9BYV2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM54Q9BYV2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM54Q9BYV2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM54Q9BYV2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms