Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
KDM5DQ9BY66 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
KDM5DQ9BY66 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
KDM5DQ9BY66 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
KDM5DQ9BY66 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
KDM5DQ9BY66 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
KDM5DQ9BY66 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
KDM5DQ9BY66 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
KDM5DQ9BY66 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
KDM5DQ9BY66 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
KDM5DQ9BY66 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
KDM5DQ9BY66 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
KDM5DQ9BY66 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
KDM5DQ9BY66 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
KDM5DQ9BY66 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
KDM5DQ9BY66 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
KDM5DQ9BY66 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
KDM5DQ9BY66 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
KDM5DQ9BY66 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC33.23■■■□□ 2.91
KDM5DQ9BY66 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
KDM5DQ9BY66 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
KDM5DQ9BY66 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
KDM5DQ9BY66 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
KDM5DQ9BY66 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
KDM5DQ9BY66 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
KDM5DQ9BY66 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
KDM5DQ9BY66 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
KDM5DQ9BY66 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
KDM5DQ9BY66 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
KDM5DQ9BY66 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
KDM5DQ9BY66 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
KDM5DQ9BY66 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
KDM5DQ9BY66 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
KDM5DQ9BY66 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
KDM5DQ9BY66 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
KDM5DQ9BY66 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
KDM5DQ9BY66 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
KDM5DQ9BY66 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
KDM5DQ9BY66 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
KDM5DQ9BY66 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
KDM5DQ9BY66 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
KDM5DQ9BY66 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
KDM5DQ9BY66 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
KDM5DQ9BY66 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
KDM5DQ9BY66 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
KDM5DQ9BY66 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
KDM5DQ9BY66 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
KDM5DQ9BY66 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
KDM5DQ9BY66 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
KDM5DQ9BY66 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
KDM5DQ9BY66 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
KDM5DQ9BY66 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
KDM5DQ9BY66 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
KDM5DQ9BY66 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
KDM5DQ9BY66 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
KDM5DQ9BY66 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
KDM5DQ9BY66 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
KDM5DQ9BY66 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
KDM5DQ9BY66 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
KDM5DQ9BY66 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
KDM5DQ9BY66 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
KDM5DQ9BY66 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
KDM5DQ9BY66 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
KDM5DQ9BY66 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
KDM5DQ9BY66 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC33.19■■■□□ 2.9
KDM5DQ9BY66 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
KDM5DQ9BY66 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
KDM5DQ9BY66 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
KDM5DQ9BY66 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
KDM5DQ9BY66 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
KDM5DQ9BY66 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
KDM5DQ9BY66 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
KDM5DQ9BY66 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
KDM5DQ9BY66 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
KDM5DQ9BY66 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
KDM5DQ9BY66 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
KDM5DQ9BY66 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
KDM5DQ9BY66 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
KDM5DQ9BY66 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
KDM5DQ9BY66 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
KDM5DQ9BY66 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
KDM5DQ9BY66 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
KDM5DQ9BY66 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
KDM5DQ9BY66 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
KDM5DQ9BY66 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
KDM5DQ9BY66 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
KDM5DQ9BY66 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
KDM5DQ9BY66 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
KDM5DQ9BY66 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
KDM5DQ9BY66 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
KDM5DQ9BY66 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
KDM5DQ9BY66 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC33.15■■■□□ 2.9
KDM5DQ9BY66 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
KDM5DQ9BY66 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
KDM5DQ9BY66 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
KDM5DQ9BY66 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
KDM5DQ9BY66 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
KDM5DQ9BY66 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
KDM5DQ9BY66 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
KDM5DQ9BY66 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms