Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TDRD1Q9BXT4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TDRD1Q9BXT4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TDRD1Q9BXT4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TDRD1Q9BXT4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TDRD1Q9BXT4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TDRD1Q9BXT4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TDRD1Q9BXT4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TDRD1Q9BXT4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TDRD1Q9BXT4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TDRD1Q9BXT4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TDRD1Q9BXT4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TDRD1Q9BXT4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TDRD1Q9BXT4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TDRD1Q9BXT4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TDRD1Q9BXT4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TDRD1Q9BXT4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TDRD1Q9BXT4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TDRD1Q9BXT4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TDRD1Q9BXT4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TDRD1Q9BXT4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TDRD1Q9BXT4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TDRD1Q9BXT4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms