Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW8

APOL6, Apolipoprotein L6, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL6Q9BWW8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
APOL6Q9BWW8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOL6Q9BWW8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOL6Q9BWW8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOL6Q9BWW8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOL6Q9BWW8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOL6Q9BWW8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOL6Q9BWW8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOL6Q9BWW8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOL6Q9BWW8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOL6Q9BWW8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOL6Q9BWW8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOL6Q9BWW8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOL6Q9BWW8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOL6Q9BWW8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
APOL6Q9BWW8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOL6Q9BWW8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOL6Q9BWW8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOL6Q9BWW8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOL6Q9BWW8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOL6Q9BWW8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOL6Q9BWW8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOL6Q9BWW8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOL6Q9BWW8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOL6Q9BWW8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOL6Q9BWW8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOL6Q9BWW8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOL6Q9BWW8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOL6Q9BWW8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOL6Q9BWW8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOL6Q9BWW8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOL6Q9BWW8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOL6Q9BWW8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOL6Q9BWW8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOL6Q9BWW8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOL6Q9BWW8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOL6Q9BWW8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOL6Q9BWW8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOL6Q9BWW8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOL6Q9BWW8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOL6Q9BWW8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOL6Q9BWW8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOL6Q9BWW8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOL6Q9BWW8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOL6Q9BWW8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOL6Q9BWW8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOL6Q9BWW8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOL6Q9BWW8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOL6Q9BWW8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOL6Q9BWW8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOL6Q9BWW8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOL6Q9BWW8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOL6Q9BWW8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOL6Q9BWW8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOL6Q9BWW8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOL6Q9BWW8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOL6Q9BWW8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOL6Q9BWW8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOL6Q9BWW8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOL6Q9BWW8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOL6Q9BWW8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
APOL6Q9BWW8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOL6Q9BWW8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOL6Q9BWW8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOL6Q9BWW8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOL6Q9BWW8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOL6Q9BWW8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOL6Q9BWW8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOL6Q9BWW8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOL6Q9BWW8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOL6Q9BWW8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOL6Q9BWW8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOL6Q9BWW8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOL6Q9BWW8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOL6Q9BWW8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOL6Q9BWW8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOL6Q9BWW8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOL6Q9BWW8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOL6Q9BWW8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOL6Q9BWW8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOL6Q9BWW8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOL6Q9BWW8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOL6Q9BWW8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOL6Q9BWW8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOL6Q9BWW8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOL6Q9BWW8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOL6Q9BWW8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms