Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFT27Q9BW83 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IFT27Q9BW83 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IFT27Q9BW83 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IFT27Q9BW83 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
IFT27Q9BW83 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
IFT27Q9BW83 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
IFT27Q9BW83 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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