Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HIGD2AQ9BW72 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HIGD2AQ9BW72 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HIGD2AQ9BW72 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HIGD2AQ9BW72 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HIGD2AQ9BW72 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HIGD2AQ9BW72 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HIGD2AQ9BW72 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HIGD2AQ9BW72 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HIGD2AQ9BW72 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HIGD2AQ9BW72 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HIGD2AQ9BW72 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
HIGD2AQ9BW72 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HIGD2AQ9BW72 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HIGD2AQ9BW72 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HIGD2AQ9BW72 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HIGD2AQ9BW72 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HIGD2AQ9BW72 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HIGD2AQ9BW72 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HIGD2AQ9BW72 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HIGD2AQ9BW72 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HIGD2AQ9BW72 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HIGD2AQ9BW72 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HIGD2AQ9BW72 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HIGD2AQ9BW72 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HIGD2AQ9BW72 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HIGD2AQ9BW72 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HIGD2AQ9BW72 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HIGD2AQ9BW72 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HIGD2AQ9BW72 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HIGD2AQ9BW72 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HIGD2AQ9BW72 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HIGD2AQ9BW72 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HIGD2AQ9BW72 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HIGD2AQ9BW72 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HIGD2AQ9BW72 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HIGD2AQ9BW72 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HIGD2AQ9BW72 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HIGD2AQ9BW72 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HIGD2AQ9BW72 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HIGD2AQ9BW72 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HIGD2AQ9BW72 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HIGD2AQ9BW72 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HIGD2AQ9BW72 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HIGD2AQ9BW72 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HIGD2AQ9BW72 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HIGD2AQ9BW72 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HIGD2AQ9BW72 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HIGD2AQ9BW72 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HIGD2AQ9BW72 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HIGD2AQ9BW72 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HIGD2AQ9BW72 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HIGD2AQ9BW72 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HIGD2AQ9BW72 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HIGD2AQ9BW72 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HIGD2AQ9BW72 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HIGD2AQ9BW72 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HIGD2AQ9BW72 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HIGD2AQ9BW72 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HIGD2AQ9BW72 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HIGD2AQ9BW72 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HIGD2AQ9BW72 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HIGD2AQ9BW72 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HIGD2AQ9BW72 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HIGD2AQ9BW72 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HIGD2AQ9BW72 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HIGD2AQ9BW72 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
HIGD2AQ9BW72 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HIGD2AQ9BW72 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HIGD2AQ9BW72 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
HIGD2AQ9BW72 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
HIGD2AQ9BW72 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
HIGD2AQ9BW72 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
HIGD2AQ9BW72 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
HIGD2AQ9BW72 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
HIGD2AQ9BW72 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIGD2AQ9BW72 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIGD2AQ9BW72 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIGD2AQ9BW72 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIGD2AQ9BW72 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIGD2AQ9BW72 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIGD2AQ9BW72 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIGD2AQ9BW72 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIGD2AQ9BW72 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIGD2AQ9BW72 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIGD2AQ9BW72 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIGD2AQ9BW72 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HIGD2AQ9BW72 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIGD2AQ9BW72 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIGD2AQ9BW72 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIGD2AQ9BW72 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIGD2AQ9BW72 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIGD2AQ9BW72 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIGD2AQ9BW72 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIGD2AQ9BW72 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HIGD2AQ9BW72 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIGD2AQ9BW72 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIGD2AQ9BW72 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HIGD2AQ9BW72 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HIGD2AQ9BW72 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms