Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM79Q9BSE2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms