Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RIOK1Q9BRS2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RIOK1Q9BRS2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RIOK1Q9BRS2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RIOK1Q9BRS2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RIOK1Q9BRS2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RIOK1Q9BRS2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RIOK1Q9BRS2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RIOK1Q9BRS2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RIOK1Q9BRS2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RIOK1Q9BRS2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RIOK1Q9BRS2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RIOK1Q9BRS2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RIOK1Q9BRS2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RIOK1Q9BRS2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RIOK1Q9BRS2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RIOK1Q9BRS2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RIOK1Q9BRS2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RIOK1Q9BRS2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
RIOK1Q9BRS2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RIOK1Q9BRS2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RIOK1Q9BRS2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RIOK1Q9BRS2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RIOK1Q9BRS2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RIOK1Q9BRS2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RIOK1Q9BRS2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RIOK1Q9BRS2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RIOK1Q9BRS2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RIOK1Q9BRS2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RIOK1Q9BRS2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RIOK1Q9BRS2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RIOK1Q9BRS2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RIOK1Q9BRS2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RIOK1Q9BRS2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RIOK1Q9BRS2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RIOK1Q9BRS2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RIOK1Q9BRS2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RIOK1Q9BRS2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RIOK1Q9BRS2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RIOK1Q9BRS2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RIOK1Q9BRS2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RIOK1Q9BRS2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RIOK1Q9BRS2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RIOK1Q9BRS2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RIOK1Q9BRS2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RIOK1Q9BRS2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RIOK1Q9BRS2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RIOK1Q9BRS2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RIOK1Q9BRS2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RIOK1Q9BRS2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RIOK1Q9BRS2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RIOK1Q9BRS2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RIOK1Q9BRS2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RIOK1Q9BRS2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RIOK1Q9BRS2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RIOK1Q9BRS2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RIOK1Q9BRS2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RIOK1Q9BRS2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RIOK1Q9BRS2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RIOK1Q9BRS2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RIOK1Q9BRS2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RIOK1Q9BRS2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RIOK1Q9BRS2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RIOK1Q9BRS2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RIOK1Q9BRS2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RIOK1Q9BRS2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RIOK1Q9BRS2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RIOK1Q9BRS2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RIOK1Q9BRS2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RIOK1Q9BRS2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
RIOK1Q9BRS2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RIOK1Q9BRS2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
RIOK1Q9BRS2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
RIOK1Q9BRS2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RIOK1Q9BRS2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RIOK1Q9BRS2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
RIOK1Q9BRS2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RIOK1Q9BRS2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RIOK1Q9BRS2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RIOK1Q9BRS2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RIOK1Q9BRS2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RIOK1Q9BRS2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RIOK1Q9BRS2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RIOK1Q9BRS2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RIOK1Q9BRS2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RIOK1Q9BRS2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RIOK1Q9BRS2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RIOK1Q9BRS2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
RIOK1Q9BRS2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RIOK1Q9BRS2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RIOK1Q9BRS2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RIOK1Q9BRS2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RIOK1Q9BRS2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RIOK1Q9BRS2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RIOK1Q9BRS2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RIOK1Q9BRS2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RIOK1Q9BRS2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RIOK1Q9BRS2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RIOK1Q9BRS2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RIOK1Q9BRS2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms