Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP7

FDXACB1, Ferredoxin-fold anticodon-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDXACB1Q9BRP7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FDXACB1Q9BRP7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FDXACB1Q9BRP7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FDXACB1Q9BRP7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FDXACB1Q9BRP7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FDXACB1Q9BRP7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FDXACB1Q9BRP7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FDXACB1Q9BRP7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FDXACB1Q9BRP7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FDXACB1Q9BRP7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FDXACB1Q9BRP7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FDXACB1Q9BRP7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FDXACB1Q9BRP7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FDXACB1Q9BRP7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FDXACB1Q9BRP7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FDXACB1Q9BRP7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FDXACB1Q9BRP7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FDXACB1Q9BRP7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FDXACB1Q9BRP7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FDXACB1Q9BRP7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FDXACB1Q9BRP7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FDXACB1Q9BRP7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FDXACB1Q9BRP7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FDXACB1Q9BRP7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FDXACB1Q9BRP7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FDXACB1Q9BRP7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FDXACB1Q9BRP7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FDXACB1Q9BRP7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FDXACB1Q9BRP7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FDXACB1Q9BRP7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FDXACB1Q9BRP7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FDXACB1Q9BRP7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FDXACB1Q9BRP7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FDXACB1Q9BRP7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FDXACB1Q9BRP7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FDXACB1Q9BRP7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FDXACB1Q9BRP7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FDXACB1Q9BRP7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FDXACB1Q9BRP7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FDXACB1Q9BRP7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FDXACB1Q9BRP7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FDXACB1Q9BRP7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FDXACB1Q9BRP7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FDXACB1Q9BRP7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FDXACB1Q9BRP7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FDXACB1Q9BRP7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FDXACB1Q9BRP7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
FDXACB1Q9BRP7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FDXACB1Q9BRP7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FDXACB1Q9BRP7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FDXACB1Q9BRP7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FDXACB1Q9BRP7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FDXACB1Q9BRP7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FDXACB1Q9BRP7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FDXACB1Q9BRP7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FDXACB1Q9BRP7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FDXACB1Q9BRP7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FDXACB1Q9BRP7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FDXACB1Q9BRP7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FDXACB1Q9BRP7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FDXACB1Q9BRP7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FDXACB1Q9BRP7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FDXACB1Q9BRP7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FDXACB1Q9BRP7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FDXACB1Q9BRP7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FDXACB1Q9BRP7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FDXACB1Q9BRP7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FDXACB1Q9BRP7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FDXACB1Q9BRP7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FDXACB1Q9BRP7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FDXACB1Q9BRP7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FDXACB1Q9BRP7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FDXACB1Q9BRP7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FDXACB1Q9BRP7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FDXACB1Q9BRP7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FDXACB1Q9BRP7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FDXACB1Q9BRP7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FDXACB1Q9BRP7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FDXACB1Q9BRP7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FDXACB1Q9BRP7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FDXACB1Q9BRP7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FDXACB1Q9BRP7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FDXACB1Q9BRP7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FDXACB1Q9BRP7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FDXACB1Q9BRP7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FDXACB1Q9BRP7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FDXACB1Q9BRP7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FDXACB1Q9BRP7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FDXACB1Q9BRP7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FDXACB1Q9BRP7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FDXACB1Q9BRP7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FDXACB1Q9BRP7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FDXACB1Q9BRP7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FDXACB1Q9BRP7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FDXACB1Q9BRP7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FDXACB1Q9BRP7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FDXACB1Q9BRP7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FDXACB1Q9BRP7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FDXACB1Q9BRP7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FDXACB1Q9BRP7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms