Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP4

PAAF1, Proteasomal ATPase-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAAF1Q9BRP4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PAAF1Q9BRP4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PAAF1Q9BRP4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PAAF1Q9BRP4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PAAF1Q9BRP4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PAAF1Q9BRP4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PAAF1Q9BRP4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PAAF1Q9BRP4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PAAF1Q9BRP4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PAAF1Q9BRP4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PAAF1Q9BRP4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PAAF1Q9BRP4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAAF1Q9BRP4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAAF1Q9BRP4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAAF1Q9BRP4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAAF1Q9BRP4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAAF1Q9BRP4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAAF1Q9BRP4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAAF1Q9BRP4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAAF1Q9BRP4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAAF1Q9BRP4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAAF1Q9BRP4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PAAF1Q9BRP4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PAAF1Q9BRP4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PAAF1Q9BRP4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PAAF1Q9BRP4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PAAF1Q9BRP4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PAAF1Q9BRP4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PAAF1Q9BRP4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms