Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SDF4Q9BRK5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SDF4Q9BRK5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms