Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ90

KLHDC3, Kelch domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC3Q9BQ90 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHDC3Q9BQ90 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHDC3Q9BQ90 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHDC3Q9BQ90 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHDC3Q9BQ90 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHDC3Q9BQ90 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHDC3Q9BQ90 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHDC3Q9BQ90 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHDC3Q9BQ90 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHDC3Q9BQ90 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms