Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VAT1Q99536 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VAT1Q99536 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VAT1Q99536 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
VAT1Q99536 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAT1Q99536 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAT1Q99536 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAT1Q99536 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAT1Q99536 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAT1Q99536 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAT1Q99536 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAT1Q99536 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAT1Q99536 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAT1Q99536 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAT1Q99536 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAT1Q99536 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAT1Q99536 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAT1Q99536 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VAT1Q99536 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VAT1Q99536 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VAT1Q99536 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VAT1Q99536 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VAT1Q99536 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
VAT1Q99536 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VAT1Q99536 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VAT1Q99536 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VAT1Q99536 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VAT1Q99536 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms