Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPS6KC1Q96S38 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS6KC1Q96S38 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KC1Q96S38 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KC1Q96S38 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KC1Q96S38 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KC1Q96S38 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KC1Q96S38 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KC1Q96S38 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KC1Q96S38 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KC1Q96S38 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS6KC1Q96S38 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS6KC1Q96S38 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS6KC1Q96S38 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS6KC1Q96S38 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS6KC1Q96S38 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS6KC1Q96S38 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms