Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT6

CTAGE1, cTAGE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE1Q96RT6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTAGE1Q96RT6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTAGE1Q96RT6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTAGE1Q96RT6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CTAGE1Q96RT6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTAGE1Q96RT6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CTAGE1Q96RT6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CTAGE1Q96RT6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CTAGE1Q96RT6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTAGE1Q96RT6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTAGE1Q96RT6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTAGE1Q96RT6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTAGE1Q96RT6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTAGE1Q96RT6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTAGE1Q96RT6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CTAGE1Q96RT6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTAGE1Q96RT6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTAGE1Q96RT6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTAGE1Q96RT6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTAGE1Q96RT6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTAGE1Q96RT6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTAGE1Q96RT6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTAGE1Q96RT6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTAGE1Q96RT6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTAGE1Q96RT6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTAGE1Q96RT6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTAGE1Q96RT6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTAGE1Q96RT6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTAGE1Q96RT6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTAGE1Q96RT6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTAGE1Q96RT6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CTAGE1Q96RT6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTAGE1Q96RT6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTAGE1Q96RT6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CTAGE1Q96RT6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTAGE1Q96RT6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTAGE1Q96RT6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CTAGE1Q96RT6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTAGE1Q96RT6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTAGE1Q96RT6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTAGE1Q96RT6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTAGE1Q96RT6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTAGE1Q96RT6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTAGE1Q96RT6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTAGE1Q96RT6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTAGE1Q96RT6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTAGE1Q96RT6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTAGE1Q96RT6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTAGE1Q96RT6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTAGE1Q96RT6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTAGE1Q96RT6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTAGE1Q96RT6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTAGE1Q96RT6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTAGE1Q96RT6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTAGE1Q96RT6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTAGE1Q96RT6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTAGE1Q96RT6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CTAGE1Q96RT6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTAGE1Q96RT6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTAGE1Q96RT6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTAGE1Q96RT6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTAGE1Q96RT6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTAGE1Q96RT6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTAGE1Q96RT6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTAGE1Q96RT6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTAGE1Q96RT6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTAGE1Q96RT6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTAGE1Q96RT6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTAGE1Q96RT6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTAGE1Q96RT6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTAGE1Q96RT6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTAGE1Q96RT6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTAGE1Q96RT6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTAGE1Q96RT6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTAGE1Q96RT6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CTAGE1Q96RT6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTAGE1Q96RT6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTAGE1Q96RT6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTAGE1Q96RT6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTAGE1Q96RT6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTAGE1Q96RT6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTAGE1Q96RT6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTAGE1Q96RT6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTAGE1Q96RT6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTAGE1Q96RT6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTAGE1Q96RT6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTAGE1Q96RT6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTAGE1Q96RT6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTAGE1Q96RT6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTAGE1Q96RT6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CTAGE1Q96RT6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTAGE1Q96RT6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTAGE1Q96RT6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTAGE1Q96RT6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTAGE1Q96RT6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTAGE1Q96RT6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTAGE1Q96RT6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTAGE1Q96RT6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTAGE1Q96RT6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTAGE1Q96RT6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms