Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU5

NEDD4L, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4-like, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4LQ96PU5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD4LQ96PU5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD4LQ96PU5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD4LQ96PU5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD4LQ96PU5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD4LQ96PU5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD4LQ96PU5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD4LQ96PU5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD4LQ96PU5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD4LQ96PU5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD4LQ96PU5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD4LQ96PU5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD4LQ96PU5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD4LQ96PU5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD4LQ96PU5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD4LQ96PU5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD4LQ96PU5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD4LQ96PU5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD4LQ96PU5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD4LQ96PU5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD4LQ96PU5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD4LQ96PU5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD4LQ96PU5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD4LQ96PU5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD4LQ96PU5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD4LQ96PU5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD4LQ96PU5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD4LQ96PU5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD4LQ96PU5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD4LQ96PU5 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD4LQ96PU5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD4LQ96PU5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEDD4LQ96PU5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEDD4LQ96PU5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEDD4LQ96PU5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEDD4LQ96PU5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEDD4LQ96PU5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEDD4LQ96PU5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEDD4LQ96PU5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEDD4LQ96PU5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEDD4LQ96PU5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NEDD4LQ96PU5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEDD4LQ96PU5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEDD4LQ96PU5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEDD4LQ96PU5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEDD4LQ96PU5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD4LQ96PU5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD4LQ96PU5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD4LQ96PU5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD4LQ96PU5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD4LQ96PU5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD4LQ96PU5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD4LQ96PU5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD4LQ96PU5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD4LQ96PU5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD4LQ96PU5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD4LQ96PU5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD4LQ96PU5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD4LQ96PU5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD4LQ96PU5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD4LQ96PU5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD4LQ96PU5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD4LQ96PU5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NEDD4LQ96PU5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NEDD4LQ96PU5 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NEDD4LQ96PU5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NEDD4LQ96PU5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NEDD4LQ96PU5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NEDD4LQ96PU5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NEDD4LQ96PU5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NEDD4LQ96PU5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NEDD4LQ96PU5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NEDD4LQ96PU5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NEDD4LQ96PU5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NEDD4LQ96PU5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NEDD4LQ96PU5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD4LQ96PU5 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD4LQ96PU5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD4LQ96PU5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD4LQ96PU5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD4LQ96PU5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD4LQ96PU5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD4LQ96PU5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD4LQ96PU5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD4LQ96PU5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD4LQ96PU5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD4LQ96PU5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD4LQ96PU5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD4LQ96PU5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD4LQ96PU5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD4LQ96PU5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD4LQ96PU5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD4LQ96PU5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD4LQ96PU5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEDD4LQ96PU5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEDD4LQ96PU5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEDD4LQ96PU5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEDD4LQ96PU5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEDD4LQ96PU5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEDD4LQ96PU5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms