Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE7

MCEE, Methylmalonyl-CoA epimerase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCEEQ96PE7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCEEQ96PE7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCEEQ96PE7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCEEQ96PE7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCEEQ96PE7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCEEQ96PE7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MCEEQ96PE7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCEEQ96PE7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCEEQ96PE7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCEEQ96PE7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCEEQ96PE7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCEEQ96PE7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCEEQ96PE7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCEEQ96PE7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCEEQ96PE7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCEEQ96PE7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCEEQ96PE7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCEEQ96PE7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCEEQ96PE7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCEEQ96PE7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCEEQ96PE7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCEEQ96PE7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCEEQ96PE7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCEEQ96PE7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCEEQ96PE7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCEEQ96PE7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MCEEQ96PE7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCEEQ96PE7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCEEQ96PE7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCEEQ96PE7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCEEQ96PE7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCEEQ96PE7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MCEEQ96PE7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCEEQ96PE7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCEEQ96PE7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCEEQ96PE7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCEEQ96PE7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCEEQ96PE7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCEEQ96PE7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MCEEQ96PE7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCEEQ96PE7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCEEQ96PE7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCEEQ96PE7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCEEQ96PE7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCEEQ96PE7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCEEQ96PE7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCEEQ96PE7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCEEQ96PE7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCEEQ96PE7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCEEQ96PE7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCEEQ96PE7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCEEQ96PE7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCEEQ96PE7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCEEQ96PE7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCEEQ96PE7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MCEEQ96PE7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCEEQ96PE7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCEEQ96PE7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms