Protein–RNA interactions for Protein: Q96NY7

CLIC6, Chloride intracellular channel protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC6Q96NY7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLIC6Q96NY7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLIC6Q96NY7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLIC6Q96NY7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLIC6Q96NY7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLIC6Q96NY7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLIC6Q96NY7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLIC6Q96NY7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLIC6Q96NY7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLIC6Q96NY7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLIC6Q96NY7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLIC6Q96NY7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLIC6Q96NY7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLIC6Q96NY7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLIC6Q96NY7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLIC6Q96NY7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CLIC6Q96NY7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLIC6Q96NY7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CLIC6Q96NY7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLIC6Q96NY7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLIC6Q96NY7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLIC6Q96NY7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CLIC6Q96NY7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLIC6Q96NY7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLIC6Q96NY7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLIC6Q96NY7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLIC6Q96NY7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLIC6Q96NY7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLIC6Q96NY7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLIC6Q96NY7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLIC6Q96NY7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLIC6Q96NY7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLIC6Q96NY7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLIC6Q96NY7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLIC6Q96NY7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLIC6Q96NY7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLIC6Q96NY7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLIC6Q96NY7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLIC6Q96NY7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLIC6Q96NY7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLIC6Q96NY7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLIC6Q96NY7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLIC6Q96NY7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLIC6Q96NY7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLIC6Q96NY7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLIC6Q96NY7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLIC6Q96NY7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLIC6Q96NY7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLIC6Q96NY7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLIC6Q96NY7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLIC6Q96NY7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLIC6Q96NY7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLIC6Q96NY7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLIC6Q96NY7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLIC6Q96NY7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLIC6Q96NY7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLIC6Q96NY7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLIC6Q96NY7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLIC6Q96NY7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLIC6Q96NY7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLIC6Q96NY7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLIC6Q96NY7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLIC6Q96NY7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLIC6Q96NY7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLIC6Q96NY7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLIC6Q96NY7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLIC6Q96NY7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLIC6Q96NY7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLIC6Q96NY7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLIC6Q96NY7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLIC6Q96NY7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLIC6Q96NY7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLIC6Q96NY7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CLIC6Q96NY7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLIC6Q96NY7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLIC6Q96NY7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLIC6Q96NY7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLIC6Q96NY7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLIC6Q96NY7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLIC6Q96NY7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLIC6Q96NY7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLIC6Q96NY7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLIC6Q96NY7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLIC6Q96NY7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLIC6Q96NY7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLIC6Q96NY7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLIC6Q96NY7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLIC6Q96NY7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLIC6Q96NY7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLIC6Q96NY7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLIC6Q96NY7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLIC6Q96NY7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLIC6Q96NY7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLIC6Q96NY7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLIC6Q96NY7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLIC6Q96NY7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLIC6Q96NY7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLIC6Q96NY7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLIC6Q96NY7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLIC6Q96NY7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms