Protein–RNA interactions for Protein: Q96NG3

TTC25, Tetratricopeptide repeat protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC25Q96NG3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC25Q96NG3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC25Q96NG3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC25Q96NG3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC25Q96NG3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC25Q96NG3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC25Q96NG3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC25Q96NG3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC25Q96NG3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC25Q96NG3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC25Q96NG3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC25Q96NG3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC25Q96NG3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC25Q96NG3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC25Q96NG3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC25Q96NG3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC25Q96NG3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms