Protein–RNA interactions for Protein: Q96N64

PWWP2A, PWWP domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PWWP2AQ96N64 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PWWP2AQ96N64 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PWWP2AQ96N64 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PWWP2AQ96N64 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PWWP2AQ96N64 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PWWP2AQ96N64 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PWWP2AQ96N64 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PWWP2AQ96N64 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PWWP2AQ96N64 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PWWP2AQ96N64 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PWWP2AQ96N64 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PWWP2AQ96N64 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PWWP2AQ96N64 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PWWP2AQ96N64 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PWWP2AQ96N64 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PWWP2AQ96N64 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PWWP2AQ96N64 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PWWP2AQ96N64 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PWWP2AQ96N64 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PWWP2AQ96N64 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PWWP2AQ96N64 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PWWP2AQ96N64 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PWWP2AQ96N64 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PWWP2AQ96N64 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PWWP2AQ96N64 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PWWP2AQ96N64 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PWWP2AQ96N64 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PWWP2AQ96N64 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PWWP2AQ96N64 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PWWP2AQ96N64 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PWWP2AQ96N64 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PWWP2AQ96N64 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PWWP2AQ96N64 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PWWP2AQ96N64 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PWWP2AQ96N64 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PWWP2AQ96N64 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PWWP2AQ96N64 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PWWP2AQ96N64 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PWWP2AQ96N64 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PWWP2AQ96N64 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PWWP2AQ96N64 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PWWP2AQ96N64 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PWWP2AQ96N64 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PWWP2AQ96N64 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PWWP2AQ96N64 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PWWP2AQ96N64 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PWWP2AQ96N64 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PWWP2AQ96N64 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PWWP2AQ96N64 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PWWP2AQ96N64 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PWWP2AQ96N64 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PWWP2AQ96N64 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PWWP2AQ96N64 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PWWP2AQ96N64 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PWWP2AQ96N64 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PWWP2AQ96N64 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PWWP2AQ96N64 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PWWP2AQ96N64 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PWWP2AQ96N64 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PWWP2AQ96N64 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PWWP2AQ96N64 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PWWP2AQ96N64 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PWWP2AQ96N64 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PWWP2AQ96N64 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PWWP2AQ96N64 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PWWP2AQ96N64 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PWWP2AQ96N64 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PWWP2AQ96N64 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PWWP2AQ96N64 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PWWP2AQ96N64 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PWWP2AQ96N64 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PWWP2AQ96N64 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PWWP2AQ96N64 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PWWP2AQ96N64 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PWWP2AQ96N64 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PWWP2AQ96N64 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PWWP2AQ96N64 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PWWP2AQ96N64 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PWWP2AQ96N64 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PWWP2AQ96N64 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PWWP2AQ96N64 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PWWP2AQ96N64 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PWWP2AQ96N64 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PWWP2AQ96N64 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PWWP2AQ96N64 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PWWP2AQ96N64 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PWWP2AQ96N64 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PWWP2AQ96N64 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PWWP2AQ96N64 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PWWP2AQ96N64 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PWWP2AQ96N64 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PWWP2AQ96N64 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PWWP2AQ96N64 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PWWP2AQ96N64 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PWWP2AQ96N64 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PWWP2AQ96N64 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PWWP2AQ96N64 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PWWP2AQ96N64 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PWWP2AQ96N64 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PWWP2AQ96N64 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms