Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN9

ZNF488, Zinc finger protein 488, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF488Q96MN9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ZNF488Q96MN9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF488Q96MN9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms