Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN2

NLRP4, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP4Q96MN2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP4Q96MN2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP4Q96MN2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP4Q96MN2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP4Q96MN2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP4Q96MN2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP4Q96MN2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP4Q96MN2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP4Q96MN2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP4Q96MN2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP4Q96MN2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP4Q96MN2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP4Q96MN2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRP4Q96MN2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRP4Q96MN2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRP4Q96MN2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRP4Q96MN2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRP4Q96MN2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRP4Q96MN2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRP4Q96MN2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRP4Q96MN2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NLRP4Q96MN2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NLRP4Q96MN2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NLRP4Q96MN2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NLRP4Q96MN2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NLRP4Q96MN2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NLRP4Q96MN2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLRP4Q96MN2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLRP4Q96MN2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLRP4Q96MN2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLRP4Q96MN2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLRP4Q96MN2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLRP4Q96MN2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLRP4Q96MN2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLRP4Q96MN2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLRP4Q96MN2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLRP4Q96MN2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLRP4Q96MN2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLRP4Q96MN2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLRP4Q96MN2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLRP4Q96MN2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLRP4Q96MN2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRP4Q96MN2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRP4Q96MN2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRP4Q96MN2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRP4Q96MN2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRP4Q96MN2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRP4Q96MN2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRP4Q96MN2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRP4Q96MN2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRP4Q96MN2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRP4Q96MN2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NLRP4Q96MN2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NLRP4Q96MN2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NLRP4Q96MN2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NLRP4Q96MN2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NLRP4Q96MN2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NLRP4Q96MN2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NLRP4Q96MN2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NLRP4Q96MN2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP4Q96MN2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP4Q96MN2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP4Q96MN2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP4Q96MN2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP4Q96MN2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP4Q96MN2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP4Q96MN2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP4Q96MN2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP4Q96MN2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP4Q96MN2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP4Q96MN2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP4Q96MN2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP4Q96MN2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP4Q96MN2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP4Q96MN2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP4Q96MN2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP4Q96MN2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP4Q96MN2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP4Q96MN2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP4Q96MN2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP4Q96MN2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP4Q96MN2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP4Q96MN2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP4Q96MN2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP4Q96MN2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP4Q96MN2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP4Q96MN2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP4Q96MN2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP4Q96MN2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP4Q96MN2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP4Q96MN2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP4Q96MN2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP4Q96MN2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP4Q96MN2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP4Q96MN2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP4Q96MN2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP4Q96MN2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP4Q96MN2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP4Q96MN2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP4Q96MN2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms