Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALPK3Q96L96 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALPK3Q96L96 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALPK3Q96L96 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALPK3Q96L96 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALPK3Q96L96 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALPK3Q96L96 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALPK3Q96L96 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALPK3Q96L96 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALPK3Q96L96 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALPK3Q96L96 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALPK3Q96L96 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALPK3Q96L96 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALPK3Q96L96 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALPK3Q96L96 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALPK3Q96L96 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALPK3Q96L96 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALPK3Q96L96 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALPK3Q96L96 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALPK3Q96L96 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALPK3Q96L96 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ALPK3Q96L96 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ALPK3Q96L96 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ALPK3Q96L96 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ALPK3Q96L96 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ALPK3Q96L96 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms