Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN2

CNDP1, Beta-Ala-His dipeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNDP1Q96KN2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNDP1Q96KN2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNDP1Q96KN2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CNDP1Q96KN2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNDP1Q96KN2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNDP1Q96KN2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNDP1Q96KN2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNDP1Q96KN2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNDP1Q96KN2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNDP1Q96KN2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNDP1Q96KN2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNDP1Q96KN2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNDP1Q96KN2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNDP1Q96KN2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNDP1Q96KN2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNDP1Q96KN2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNDP1Q96KN2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNDP1Q96KN2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNDP1Q96KN2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNDP1Q96KN2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNDP1Q96KN2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNDP1Q96KN2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNDP1Q96KN2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNDP1Q96KN2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNDP1Q96KN2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNDP1Q96KN2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNDP1Q96KN2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNDP1Q96KN2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNDP1Q96KN2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CNDP1Q96KN2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNDP1Q96KN2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNDP1Q96KN2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNDP1Q96KN2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNDP1Q96KN2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNDP1Q96KN2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNDP1Q96KN2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNDP1Q96KN2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNDP1Q96KN2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNDP1Q96KN2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNDP1Q96KN2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNDP1Q96KN2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNDP1Q96KN2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNDP1Q96KN2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNDP1Q96KN2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNDP1Q96KN2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNDP1Q96KN2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNDP1Q96KN2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNDP1Q96KN2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNDP1Q96KN2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNDP1Q96KN2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNDP1Q96KN2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNDP1Q96KN2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNDP1Q96KN2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNDP1Q96KN2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNDP1Q96KN2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNDP1Q96KN2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNDP1Q96KN2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNDP1Q96KN2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNDP1Q96KN2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNDP1Q96KN2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNDP1Q96KN2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNDP1Q96KN2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNDP1Q96KN2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNDP1Q96KN2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CNDP1Q96KN2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNDP1Q96KN2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CNDP1Q96KN2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNDP1Q96KN2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNDP1Q96KN2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNDP1Q96KN2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNDP1Q96KN2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNDP1Q96KN2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNDP1Q96KN2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNDP1Q96KN2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNDP1Q96KN2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CNDP1Q96KN2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CNDP1Q96KN2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNDP1Q96KN2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNDP1Q96KN2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNDP1Q96KN2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNDP1Q96KN2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNDP1Q96KN2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNDP1Q96KN2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNDP1Q96KN2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNDP1Q96KN2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNDP1Q96KN2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNDP1Q96KN2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNDP1Q96KN2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNDP1Q96KN2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNDP1Q96KN2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNDP1Q96KN2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CNDP1Q96KN2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNDP1Q96KN2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNDP1Q96KN2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNDP1Q96KN2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNDP1Q96KN2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNDP1Q96KN2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CNDP1Q96KN2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNDP1Q96KN2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNDP1Q96KN2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms