Protein–RNA interactions for Protein: Q96JW4

SLC41A2, Solute carrier family 41 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A2Q96JW4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC41A2Q96JW4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC41A2Q96JW4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC41A2Q96JW4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC41A2Q96JW4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC41A2Q96JW4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC41A2Q96JW4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC41A2Q96JW4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC41A2Q96JW4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC41A2Q96JW4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC41A2Q96JW4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC41A2Q96JW4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC41A2Q96JW4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC41A2Q96JW4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC41A2Q96JW4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC41A2Q96JW4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC41A2Q96JW4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC41A2Q96JW4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC41A2Q96JW4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC41A2Q96JW4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC41A2Q96JW4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC41A2Q96JW4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC41A2Q96JW4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC41A2Q96JW4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC41A2Q96JW4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC41A2Q96JW4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC41A2Q96JW4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC41A2Q96JW4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC41A2Q96JW4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC41A2Q96JW4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC41A2Q96JW4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC41A2Q96JW4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC41A2Q96JW4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC41A2Q96JW4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC41A2Q96JW4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC41A2Q96JW4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC41A2Q96JW4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC41A2Q96JW4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC41A2Q96JW4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC41A2Q96JW4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC41A2Q96JW4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC41A2Q96JW4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC41A2Q96JW4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC41A2Q96JW4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC41A2Q96JW4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC41A2Q96JW4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC41A2Q96JW4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC41A2Q96JW4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC41A2Q96JW4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC41A2Q96JW4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC41A2Q96JW4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC41A2Q96JW4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC41A2Q96JW4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC41A2Q96JW4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC41A2Q96JW4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC41A2Q96JW4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC41A2Q96JW4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC41A2Q96JW4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC41A2Q96JW4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC41A2Q96JW4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC41A2Q96JW4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC41A2Q96JW4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC41A2Q96JW4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC41A2Q96JW4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC41A2Q96JW4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC41A2Q96JW4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC41A2Q96JW4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC41A2Q96JW4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC41A2Q96JW4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC41A2Q96JW4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC41A2Q96JW4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC41A2Q96JW4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC41A2Q96JW4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC41A2Q96JW4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC41A2Q96JW4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC41A2Q96JW4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC41A2Q96JW4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC41A2Q96JW4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC41A2Q96JW4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC41A2Q96JW4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC41A2Q96JW4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC41A2Q96JW4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC41A2Q96JW4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC41A2Q96JW4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC41A2Q96JW4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC41A2Q96JW4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC41A2Q96JW4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC41A2Q96JW4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC41A2Q96JW4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC41A2Q96JW4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC41A2Q96JW4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC41A2Q96JW4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC41A2Q96JW4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC41A2Q96JW4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC41A2Q96JW4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC41A2Q96JW4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC41A2Q96JW4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC41A2Q96JW4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC41A2Q96JW4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC41A2Q96JW4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms