Protein–RNA interactions for Protein: Q96IY1

NSL1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSL1Q96IY1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NSL1Q96IY1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NSL1Q96IY1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NSL1Q96IY1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NSL1Q96IY1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NSL1Q96IY1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NSL1Q96IY1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NSL1Q96IY1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NSL1Q96IY1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NSL1Q96IY1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NSL1Q96IY1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NSL1Q96IY1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NSL1Q96IY1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NSL1Q96IY1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NSL1Q96IY1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NSL1Q96IY1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NSL1Q96IY1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NSL1Q96IY1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NSL1Q96IY1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NSL1Q96IY1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NSL1Q96IY1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NSL1Q96IY1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NSL1Q96IY1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NSL1Q96IY1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NSL1Q96IY1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NSL1Q96IY1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NSL1Q96IY1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms