Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY0

ZC2HC1A, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1AQ96GY0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ZC2HC1AQ96GY0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZC2HC1AQ96GY0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZC2HC1AQ96GY0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZC2HC1AQ96GY0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZC2HC1AQ96GY0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZC2HC1AQ96GY0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZC2HC1AQ96GY0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZC2HC1AQ96GY0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZC2HC1AQ96GY0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZC2HC1AQ96GY0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZC2HC1AQ96GY0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZC2HC1AQ96GY0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZC2HC1AQ96GY0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZC2HC1AQ96GY0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZC2HC1AQ96GY0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZC2HC1AQ96GY0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZC2HC1AQ96GY0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZC2HC1AQ96GY0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZC2HC1AQ96GY0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZC2HC1AQ96GY0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZC2HC1AQ96GY0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZC2HC1AQ96GY0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZC2HC1AQ96GY0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZC2HC1AQ96GY0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZC2HC1AQ96GY0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZC2HC1AQ96GY0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZC2HC1AQ96GY0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZC2HC1AQ96GY0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZC2HC1AQ96GY0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZC2HC1AQ96GY0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZC2HC1AQ96GY0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZC2HC1AQ96GY0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZC2HC1AQ96GY0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZC2HC1AQ96GY0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZC2HC1AQ96GY0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZC2HC1AQ96GY0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZC2HC1AQ96GY0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZC2HC1AQ96GY0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZC2HC1AQ96GY0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZC2HC1AQ96GY0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZC2HC1AQ96GY0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZC2HC1AQ96GY0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZC2HC1AQ96GY0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZC2HC1AQ96GY0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZC2HC1AQ96GY0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZC2HC1AQ96GY0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZC2HC1AQ96GY0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ZC2HC1AQ96GY0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZC2HC1AQ96GY0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZC2HC1AQ96GY0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZC2HC1AQ96GY0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZC2HC1AQ96GY0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ZC2HC1AQ96GY0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZC2HC1AQ96GY0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZC2HC1AQ96GY0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZC2HC1AQ96GY0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZC2HC1AQ96GY0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZC2HC1AQ96GY0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZC2HC1AQ96GY0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZC2HC1AQ96GY0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZC2HC1AQ96GY0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZC2HC1AQ96GY0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZC2HC1AQ96GY0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZC2HC1AQ96GY0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZC2HC1AQ96GY0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms