Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCMH1Q96GD3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCMH1Q96GD3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCMH1Q96GD3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCMH1Q96GD3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCMH1Q96GD3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCMH1Q96GD3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCMH1Q96GD3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCMH1Q96GD3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCMH1Q96GD3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCMH1Q96GD3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCMH1Q96GD3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCMH1Q96GD3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCMH1Q96GD3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCMH1Q96GD3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCMH1Q96GD3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCMH1Q96GD3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCMH1Q96GD3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCMH1Q96GD3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCMH1Q96GD3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCMH1Q96GD3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCMH1Q96GD3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCMH1Q96GD3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCMH1Q96GD3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCMH1Q96GD3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCMH1Q96GD3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCMH1Q96GD3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCMH1Q96GD3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCMH1Q96GD3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCMH1Q96GD3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCMH1Q96GD3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms