Protein–RNA interactions for Protein: Q96ET8

TVP23C, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog C, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23CQ96ET8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TVP23CQ96ET8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TVP23CQ96ET8 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms