Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM44Q96DX7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM44Q96DX7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM44Q96DX7 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM44Q96DX7 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM44Q96DX7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM44Q96DX7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM44Q96DX7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM44Q96DX7 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM44Q96DX7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM44Q96DX7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM44Q96DX7 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM44Q96DX7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM44Q96DX7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM44Q96DX7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM44Q96DX7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM44Q96DX7 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM44Q96DX7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM44Q96DX7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM44Q96DX7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM44Q96DX7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM44Q96DX7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM44Q96DX7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM44Q96DX7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM44Q96DX7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM44Q96DX7 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM44Q96DX7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM44Q96DX7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM44Q96DX7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM44Q96DX7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM44Q96DX7 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM44Q96DX7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM44Q96DX7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM44Q96DX7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM44Q96DX7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM44Q96DX7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM44Q96DX7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM44Q96DX7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM44Q96DX7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM44Q96DX7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM44Q96DX7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM44Q96DX7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM44Q96DX7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM44Q96DX7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM44Q96DX7 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM44Q96DX7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM44Q96DX7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM44Q96DX7 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM44Q96DX7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM44Q96DX7 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM44Q96DX7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM44Q96DX7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM44Q96DX7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM44Q96DX7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM44Q96DX7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM44Q96DX7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM44Q96DX7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM44Q96DX7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM44Q96DX7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM44Q96DX7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM44Q96DX7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms