Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
NMD3Q96D46 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NMD3Q96D46 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms