Protein–RNA interactions for Protein: Q96CT2

KLHL29, Kelch-like protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL29Q96CT2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL29Q96CT2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL29Q96CT2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL29Q96CT2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL29Q96CT2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL29Q96CT2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL29Q96CT2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL29Q96CT2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL29Q96CT2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL29Q96CT2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL29Q96CT2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL29Q96CT2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL29Q96CT2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL29Q96CT2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL29Q96CT2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL29Q96CT2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL29Q96CT2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL29Q96CT2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL29Q96CT2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL29Q96CT2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL29Q96CT2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL29Q96CT2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL29Q96CT2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL29Q96CT2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL29Q96CT2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL29Q96CT2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL29Q96CT2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL29Q96CT2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL29Q96CT2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL29Q96CT2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL29Q96CT2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL29Q96CT2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL29Q96CT2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL29Q96CT2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL29Q96CT2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL29Q96CT2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL29Q96CT2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL29Q96CT2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL29Q96CT2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL29Q96CT2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL29Q96CT2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL29Q96CT2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL29Q96CT2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL29Q96CT2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL29Q96CT2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL29Q96CT2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL29Q96CT2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL29Q96CT2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL29Q96CT2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL29Q96CT2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL29Q96CT2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL29Q96CT2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL29Q96CT2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL29Q96CT2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL29Q96CT2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL29Q96CT2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL29Q96CT2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL29Q96CT2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL29Q96CT2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL29Q96CT2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL29Q96CT2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL29Q96CT2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL29Q96CT2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL29Q96CT2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL29Q96CT2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL29Q96CT2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL29Q96CT2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms